لاتانوپروست ممكن است به علت افزایش محتوای ملانین در ملانوسیت ها، سبب افزایش تدریجی مقدار پیگمان قهوه ای در عنبیه شود. تیرگی، ضخیم شدن و بزرگ شدن پلك ها، تاری دید، سوزش و خارش، پرخونی ملتحمه، احساس وجود جسم خارجی در چشم، خیز و قرمزی پلك، دوبینی، ترس از نور، ترشح از چشم، پارگی شبكیه و خونریزی زجاجیه، از عوارض مصرف این دارو هستند.